A proximidade com o Parque Nacional de Itatiaia e o estado primitivo de outras matas da região emprestam à Visconde de Mauá uma extraordinária riqueza natural, onde a flora se destaca. A floresta subtropical, com altitudes de 1.300 metros em média, favorece a hegemonia da araucária, os famosos pinheiros que também fornecem a pinha, muito aproveitado nas receitas da culinária local. Encontram-se na área as mais variadas espécies nativas como cedros, quaresmeiras, ipês, bromélias, orquídeas, e uma infinita variedade de floríferas, enquanto que nos campos abertos as ervas medicinais, hoje valorizadas pela fitoterapia mas há muitos anos já utilizadas pelas famílias do lugar, como a macela, arnica, carqueja, e etc.. O clima de Mauá favorece também a formação de pomares, inclusive de espécies da Europa próprias de regiões frias, que convivem com espécies nativas. A variedade de flores e de frutas atrai pássaros de todos os tipos, sendo em maior número os beija-flores; encontramos em áreas de mata fechada aves como gavião real, a siriema, jacutingas e tucanos. A fauna local é bastante variada, e não apenas na classe das aves. Entre os mamíferos, por exemplo, as matas da região ainda abrigam a suçuarana (o maior puma da América do Sul, em vias de extinção), a jaguatirica, a onça pintada, várias espécies de macacos (bugio e mono carvoeiro), tatu canastra (em extinção) e capivaras.